Ameerika ulmetelevisiooni seriaali "Top Secret" kolmas hooaeg, mis hõlmas 24 osa, algas 22. septembril 1995 ja kestis 17. maini 1996. Saate viis läbi Fox. Sari rääkis juttu föderaalse juurdlusbüroo eriesindajate (FBI - Fox Mulder (David Duchovny) ja Dani Scully (Gillian Anderson)). Peategelased uurivad paranormaalsete ja salapäraste nähtuste juhtumeid, mida tuntakse templiga "X".
Hooaeg lõppes stsenaariumi ridadega, mis algasid juba teisest hooajast ning tutvustasid mitmeid uusi süžeelemente. Peamine narratiiv keskendub vandenõule, mille eesmärk on varjata Mulderi omandatud tulnukate lahkamise videot, otsides Scully õe tapjat ja hr X-i ümbritsevat mõistatust (Stephen Williams). Hooaja 3 maatükil tabasid esimest korda sellised tegelased nagu Esimene vanem (Don Sec. Williams) ja musta tulnukate viirus. Lisaks esitleb see hooaeg laias valikus "nädala koletisi": episoodid sisaldavad iseseisvaid lugusid ega mõjuta sarja üldist mütoloogiat.
Hooaeg ületas kahe eelmise hindeid. Esietenduse episood "Õnnistatud tee" debüteeris Nielseni reitinguga 19, 94 miljonit vaatajat, mis kahekordistas eelmise hooaja esilinastust. Saadete jooksul ületas reiting järjekindlalt 15 miljonit vaatajat, tehes temast ühe populaarseima telesarja USA televisioonis hooajal 1995-1996. Hooaeg sai peamiselt telekriitikute positiivseid ülevaateid ja võitis viis Emmy auhinda. Paljud stsenaristi Darin Morgani kirjutatud episoodid, eriti “Clyde Brackmani viimane puhkus” ja ““ Kosmosest “Joe Chang”, on saanud sarja ühe parima tunnustuse. Morgan lahkus sarjast pärast 3. hooaja lõpetamist suutmatuse tõttu sammu pidada saate dünaamilise olemusega. Ta naasis alles kümnendal ja üheteistkümnendal hooajal.
Krunt
FBI agent Fox Mulder leitakse kõrbes pooleldi surnuna pärast seda, kui suitsetaja käskis sõjaväel teaduslike katsete tõenditega auto põletada, teadmata, et Mulder on seal sees. Navaho indiaanlane Albert Gostin toob Fox Mulderi ellu tagasi. Vahepeal uurib Scully rõugete likvideerimise programmi võimalikku kaasamist enne inimestega tehtavaid geneetilisi katseid. Ta avastas, et pärast II maailmasõda Ühendriikidesse põgenenud natsiteadlane tegi Paperclipiga eksperimenti eesmärgiga luua inimeste ja välismaalaste hübriid. Selle tagajärjel mõrvatakse Scully ja ta tapeti kogemata tema õde Melissa, kes oli segi ajatud Deina endaga.
Uurides välismaalaste lahkamise tõendeid, astub Mulder välja inimese-välismaalase hübriidi klassifitseeritud valitsuse raudteeveo radadel. Foxil õnnestub sattuda ühte neist autodest, kus ta peaaegu sureb sündikaadi valvurite käes. Informaator hr X päästab ta siiski. Vahepeal siseneb Scully naisrühma, keda on röövitud ka temaga sarnaselt, ning kohtub teise sündikaadi liikmega, keda tuntakse esimese vanemana, kes väidab, et ta pandi röövimise ajal samasugusesse vankrisse ja sattus Jaapani teadlaste katsete ohvriks.
Kiirguse ohvriks langeb Prantsuse päästelaeva meeskond, mis üritab merepõhja tõsta Teise maailmasõja ajastut allveelaeva. Ainus erand on sukelduja, kes on nakatunud allveelaevast leitud parasiidiga. See maaväline maaviirus, mis kontrollis ohvrite kehasid, vallutas lõpuks Alex Kryceki surnukeha, mille Fox Mulder läks otsima ja võttis ta vahi alla. Selle tagajärjel pandi nakatunud Krycek raketi miinile, mida kasutati UFO varjamiseks ja parasiit lahkus tema kehast. Vahepeal õnnestub Scullyl tabada Louis Cardinalit, meest, kes vastutab oma õe mõrva eest.
